┌─水陸草木之花──────────總綱　　　　　　　┐　　　　　　｜　可愛者甚蕃　　　　　　　　　　　　　　　　　　　  ｜
　　　　　　｜　晉陶淵明獨愛菊─────────正陪┐　　　　　　｜
　　　　┌敘｜　自李唐來世人盛愛牡丹──────反襯┘點　　　　　｜勢疾　　　　　　　　｜寫｜　　　　　　┌出淤泥而不染───┐　　　　　　　　  ｜意周
　　　　｜　｜　　　　　　｜濯清漣而不妖　　　｜　　　　　　　　  ｜  
　　　　｜　｜　　　　　　｜中通外直　　　　　｜　　　　　　　　  ｜
　　　愛｜　└─予獨愛蓮之｜不蔓不枝   　　　 ｜主寫蓮德　　┐ 　 ｜　
　　　蓮｜　　　　　　　　｜香遠益清  　　  　｜為主旨作敷陳┘染  ┘   　　　　　　說｜　　　　　　　　｜亭亭淨植　　　　　｜
　　　　｜　　　　　　　　└可遠觀而不可褻玩焉┘
　　　　｜　　花┌予謂　　　　　　　　　　　　─────────┐　
　　　　｜論┌之｜菊花之隱逸者也　　　　　　　　　　　　　　　　｜
　　　　└議｜品｜牡丹花之富貴者也　　　　　　　　　　　　　　　｜文曲     　          │  └蓮花之君子者也　　　　　　　　　　　　　　　　｜氣爽　　　　　　｜愛┌噫　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　｜
　　　　　　└之｜菊之愛陶後鮮有聞┐　　　　　　　　　　　　　　｜
　　　　　　　別｜蓮之愛同予者何人｜暗點主旨──────────┘
　　　　　　　　└牡丹之愛宜乎眾矣┘
    顏子云：「舜何人也，予何人也，有為者亦若是。」聖凡分別，在乎存心。濂溪先生以光風霽月之襟懷，做為聖為賢的功夫，既感人心所嚮，於是藉蓮花的特色，寫君子德操，以為風氣之倡。古人為文但求益世，取象寄意，用心深遠，非徒花木風月之好，所謂「有德者必有言」，實為踐形履實，閎中肆外之德言。
　　本文共分兩段。自「水陸草木之花」至「可遠觀而不可褻玩焉」為首段。旨在寫蓮之德隱契君子。首句總起一筆。「水陸草木之花」已涵括後文所論眾卉。「可愛者甚蕃」領起下三句之各有所愛，而「愛」字意貫全文。次三句承首句之意，分而為三。先依時代先後作一正一反之鋪述，引出「愛蓮」，兼點題目。而「菊」應首句之陸而草本者，「牡丹」應首句之陸而木本者，「蓮」應首句之水而草本者。繼而筆勢疾下，旋即落入蓮品的繪寫，連作七句，一氣呵成，將君子的德操一一契入。「出淤泥而不染」比喻能卻外境，不移於俗。「濯清漣而不妖」再喻浸潤德教，不媚於世。「中通」者就內心之境而言，心性靈澈，事理圓融。「外直」者，就外在之言行而論，乃是不屈不邪，中正和平。「不蔓不枝」則指主一不雜，醇正一貫。「香遠益清」言德馨遠播，既廣且久，當含時、空兩義而言。「亭亭淨植」則卓然自立，超類拔萃，不愧不怍於天地之間。因此在相上顯示出來的是威儀棣棣，為眾人所法象，所謂「可遠觀而不可褻玩焉。」以上七句，字字寫蓮而無非為君子之德作一描繪。人果能於日常言行，舉心動念之間，滌心淨慮，明德勵行，一如文中所述，當不愧為讀書明理的君子人。
　　從「予謂」到「牡丹之愛宜乎眾矣」為次段。旨在論花之品而慨嘆所受各異。本段又分為兩層。先論斷菊花開在眾芳蕪穢的秋天，不與繁花爭艷，冷雨嚴霜之中，猶自崢嶸，一若人中隱士，不以富貴名利為念，獨抱貞節，超塵逸居，所以說，菊是花中的隱士。牡丹氣度雍容，富艷難縱，一若富貴門第，世所同羨。所以說，牡丹是花之富貴者也。蓮應首段「出淤泥而不染」以下七句之描寫，在此正式揭出「君子」二字，以其所繪正是君子氣象。本段至此為第一層。先以「予謂」提接，然後用論斷之筆遙接首段次三句，辨定花卉之品。以「隱逸」扣「陶淵明」；以「富貴」扣世人；以「君子」扣己，並照應寫蓮七句。自「噫」字至「宜乎眾矣」為第二層。「菊之愛，陶後鮮有聞」實肇因於真隱難尋；「蓮之愛同予者何人」以明德、勵德者世不多見，而深諷「同予者何人」句，言外期盼之殷，囑望之切，如聞其聲，如見其人，所謂「德不孤必有鄰」志於道者又當如何奮起呢！由「牡丹之愛宜乎眾矣」亦隱隱可窺賢哲感時憂世之端倪。上層花品既已辨定，此層再以「噫」字作慨嘆，轉入愛花者的品格，仍一一照應前段。文中雖不作軒輊之評，而賓主自見，全文主旨也在此處含蓄點出。
總論：
　　本篇乃作者履道抒懷，心存濟益之言。全文藉蓮之品寫君子之德以為天下倡，期轉富貴之嚮慕為崇德之風尚，為全文主旨。先立總綱於前，中就蓮之勝妙描摹盡致，全寫君子，為主旨作敷陳。末就花品之異，辨愛之別，暗點主旨，這是本文構篇組織之法。
　　文中以君子之德為倡，然於主旨、終不明示，論議止於花品愛尚。寫德但言花卉清妙，而弦外餘韻，味永意長。這種暗點主旨的方法，是本文的第一個特色。全文總起一筆，下分為三，陪筆用點，主筆用染，自首迄尾，據此論斷，反覆循環，未嘗出其畛域，而旨明意豁，神理峻拔，這是本文的第二個特色。前半繪寫，文意周圓而氣勢迅疾，一氣而下，如飛瀑出崖〈勢疾而意周〉，後半論判，迴環往復，重疊曲折，有如迥峰三疊，而文氣卻朗暢舒爽，不為阻滯〈文曲氣爽〉。文中句法的排列〈對句、排句、散句〉整秩中不失錯落，因此在聲調上就顯得諧和而抑揚頓挫。這是本文的第三個特色。
補白：
    上交不諂　
    下交不驕